181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2959 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  86.3 
 
 		 217 aa  400  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  83.11 
 
 		 219 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  85.39 
 
 		 217 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  83.11 
 
 		 219 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  83.56 
 
 		 241 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  84.47 
 
 		 217 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  68.22 
 
 		 224 aa  310  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  68.22 
 
 		 224 aa  310  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  68.06 
 
 		 224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  66.51 
 
 		 225 aa  308  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  72.4 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  65.58 
 
 		 215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  65.12 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  65.12 
 
 		 225 aa  304  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  65.58 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  65.89 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  64.84 
 
 		 229 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  63.93 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  65.42 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  63.93 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  64.65 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  64.65 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  64.49 
 
 		 215 aa  296  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  63.72 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  64.19 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  63.08 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  61.82 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  61.82 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  60.83 
 
 		 219 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  63.08 
 
 		 223 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  64.19 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  61.68 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  62.62 
 
 		 218 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  61.47 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  61.01 
 
 		 218 aa  278  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  61.93 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  61.98 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  57.01 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  55.3 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  57.6 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  52.97 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  52.97 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  42.47 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  38.01 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  41.75 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  41.75 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  37.79 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  34.65 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  36.57 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  36.11 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.58 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  34.76 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  37.57 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  34.55 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  34.25 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  33.81 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  33.84 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.11 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  34.76 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  30.2 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  32.66 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  31.02 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  30.56 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  33.5 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  33 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  37.95 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  37.19 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  33 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.65 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.62 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  32.98 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  32.98 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  28.5 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  43.4 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  33.92 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  34.24 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  29.7 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  32.5 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  31.98 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  44.07 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  32 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  32.68 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.5 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  31.63 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.5 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  31.55 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>