160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0184 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  90.19 
 
 
215 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  79.25 
 
 
214 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  77.25 
 
 
213 aa  340  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  63.59 
 
 
214 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  63.13 
 
 
214 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  63.59 
 
 
214 aa  284  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  64.06 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  63.13 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  64.06 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  62.67 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  62.67 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  63.13 
 
 
214 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  63.13 
 
 
214 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  63.13 
 
 
214 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  62.67 
 
 
214 aa  277  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  62.67 
 
 
214 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  62.67 
 
 
214 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  62.67 
 
 
214 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  62.67 
 
 
214 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  62.21 
 
 
214 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  61.75 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  57.94 
 
 
238 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  57.94 
 
 
237 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  57.6 
 
 
212 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  55.87 
 
 
218 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  58.69 
 
 
205 aa  224  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  52.13 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  51.64 
 
 
211 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  52.61 
 
 
214 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  51.4 
 
 
215 aa  191  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  51.66 
 
 
219 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  51.63 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  51.64 
 
 
219 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  49.76 
 
 
214 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  46.3 
 
 
208 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  44.02 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.77 
 
 
227 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  42.03 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  44.9 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  43.94 
 
 
219 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  43.3 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  42.93 
 
 
219 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  40.19 
 
 
205 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  40.19 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  40.55 
 
 
210 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  38.46 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  38.46 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  36.6 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  40.72 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.84 
 
 
215 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  40.2 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  36.19 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  38.65 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  35.02 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  35.65 
 
 
222 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  36.11 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  40.1 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.29 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  33.65 
 
 
241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.33 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  40.1 
 
 
209 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  38.94 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.81 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  39.59 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  40.49 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  35.24 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  35.27 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  31.43 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  31.43 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  31.43 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  35.21 
 
 
218 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  30.95 
 
 
219 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  34.31 
 
 
224 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  33.95 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  33.5 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  33.5 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  32.08 
 
 
215 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  33.02 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  32.67 
 
 
223 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  39.02 
 
 
211 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  32.66 
 
 
235 aa  108  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  31.28 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.02 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  33.67 
 
 
221 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  32.23 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  30.81 
 
 
215 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  31.84 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  32.84 
 
 
224 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  32.84 
 
 
224 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  30.81 
 
 
215 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  31.66 
 
 
217 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.16 
 
 
241 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>