141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1690 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  31.19 
 
 
201 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  32.69 
 
 
222 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  32.69 
 
 
242 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  30.43 
 
 
205 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  31.31 
 
 
240 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  29.95 
 
 
205 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  31.31 
 
 
241 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  29.67 
 
 
235 aa  101  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.58 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.58 
 
 
221 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.14 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  29.33 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  32.34 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  33.88 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  27.4 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
217 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  37.69 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  37.19 
 
 
211 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  32.71 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  36.68 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  27.94 
 
 
224 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.69 
 
 
211 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  32.54 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  30.14 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  28.5 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  27.45 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  27.45 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  34.17 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  35.2 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  28.23 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  27.49 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  26.63 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  27.75 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  27.75 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  31.79 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.85 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  33.81 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  28.36 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.13 
 
 
214 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.61 
 
 
214 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.61 
 
 
214 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  29.08 
 
 
225 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  29.61 
 
 
218 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  32.41 
 
 
209 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  27.59 
 
 
223 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  29.61 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  29.81 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.85 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.61 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  34.76 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  26.21 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.37 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  28.64 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  32.5 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  29.63 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  29.85 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  25.54 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  32.4 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  31.79 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  30.85 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  34.97 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  31.22 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  30.22 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  28.26 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  29.81 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  26.96 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  27.8 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  25.73 
 
 
215 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.99 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  26.83 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  26.47 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  29.9 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  31.38 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  28.8 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  31.28 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  27.75 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  27.75 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  31.18 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  27.32 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  30.11 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  29.06 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  30.15 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  29.19 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  31.28 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  27.64 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  27.64 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  29.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  27.98 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.57 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  26.87 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  27.14 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>