189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0917 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  93.84 
 
 		 211 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  93.36 
 
 		 211 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  93.84 
 
 		 211 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  77.03 
 
 		 209 aa  337  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  71.56 
 
 		 211 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  73.21 
 
 		 210 aa  294  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  71.29 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  66.51 
 
 		 209 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  66.18 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  66.03 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  43.84 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  38.89 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  41.58 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  41.09 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  38.05 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  37.56 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  41.49 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  37.96 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  41.29 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  41.35 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  39.36 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  40.58 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  39.35 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  40.38 
 
 		 242 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  40.67 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  41.09 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  37.07 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.48 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  37.38 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.48 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  39.05 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.52 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.52 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  38.83 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  37.25 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.1 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  38.65 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.62 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  39.6 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.71 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.6 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  36.19 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  40.1 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  36 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  37.62 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  37.62 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  38.97 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  37.62 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  37.62 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  40.76 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  38.16 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  37.7 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  38.54 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  38.42 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  36.41 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  37.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  35.21 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.07 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  40.58 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  40.58 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.47 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.74 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  33.84 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  37.62 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  32.67 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  32.67 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.43 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  31.07 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  30.58 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  38.12 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  31.6 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  32.09 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  32.09 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  32.18 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  34.72 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  35.5 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  33.16 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.19 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  31.16 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  34.33 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  32.2 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  33.17 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  32.94 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  33.17 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  32.64 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  33.83 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  30.29 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  33 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  35.68 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  32.02 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>