133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2583 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  88.58 
 
 		 219 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  88.13 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  45.89 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  47.4 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  44.97 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  43.41 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  43.87 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  43.94 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  43.43 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  48.96 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.64 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  43.15 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  43.08 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  41.62 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  41.62 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  41.92 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.93 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.12 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.12 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.12 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  41.12 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.41 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  41.41 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.91 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  41.24 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  41.24 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  41.24 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  41.24 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  37.56 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  40.1 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  39.23 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  40.21 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  37.93 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  37.85 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  39.89 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  38.05 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.98 
 
 		 237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  37.98 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  38.95 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  36.19 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  35.61 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  38.86 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.7 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.08 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  36.06 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  32.85 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  36.55 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.54 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  34.6 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  35.35 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  33.51 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  37.06 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  32.99 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  32.47 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  32.47 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  29.86 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  32.65 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  30.2 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  35.53 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  32.65 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.53 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  33.72 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  30.66 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  30.49 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  30.49 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  30.94 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  30.94 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  33.17 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  28.31 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  27.85 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  30.04 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  28.36 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  29.46 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  41.59 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  26.61 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  26.61 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  30.36 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  26.15 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  29.72 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  28.84 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  28.84 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  28.84 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  25.91 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  28.84 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  28.37 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  26.61 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  27.85 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.44 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  29.15 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>