138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2944 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  98.6 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  95.33 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  95.33 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  95.79 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  94.39 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  93.46 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  87.38 
 
 		 214 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  85.98 
 
 		 214 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  85.98 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  85.98 
 
 		 214 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  82.71 
 
 		 214 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  82.24 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  82.24 
 
 		 214 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  68.2 
 
 		 213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  66.36 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  64.06 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  64.06 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  63.13 
 
 		 215 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  54.15 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  53.71 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  52.73 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  56.81 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  54.13 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 214 aa  214  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  55.14 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  52.75 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  49.31 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  50.46 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  53.42 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  48.61 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  47.39 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.8 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  42.23 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  41 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  39.5 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  39.52 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  39.52 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  40.83 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  38.54 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  40.2 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  40.2 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.21 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  37.62 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  39.35 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  40.1 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  40.29 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  36.84 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  36.84 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  36.84 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  34.6 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  41.06 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  40.2 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  33.65 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  39.61 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.81 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.6 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  37.08 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  33.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  32.26 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  32.86 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  30.95 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.65 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  30.48 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  30.48 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.18 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  30.48 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  32.66 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  34.2 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  32.97 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  32.04 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  31.55 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  31.84 
 
 		 217 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  31.28 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  46.96 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  29.85 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  30.66 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  30.66 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  29.72 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  32.58 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>