178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1239 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  90.78 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  87.67 
 
 		 241 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  86.76 
 
 		 219 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  88.02 
 
 		 217 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  86.76 
 
 		 219 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  85.39 
 
 		 219 aa  394  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  70.28 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  69.95 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  70.28 
 
 		 225 aa  318  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  70.28 
 
 		 225 aa  317  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  69.34 
 
 		 224 aa  315  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  69.01 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  69.01 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  69.01 
 
 		 224 aa  313  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  68.08 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  66.82 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  66.36 
 
 		 215 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  72.4 
 
 		 235 aa  304  7e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  66.67 
 
 		 215 aa  304  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  67.45 
 
 		 223 aa  303  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  65.73 
 
 		 215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  64.35 
 
 		 218 aa  300  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  64.35 
 
 		 218 aa  300  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  65.26 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  65.73 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  65.73 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  64.52 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  65.09 
 
 		 218 aa  298  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  64.79 
 
 		 215 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  63.68 
 
 		 219 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  63.68 
 
 		 218 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  63.21 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  62.91 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  61.57 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  61.11 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  61.57 
 
 		 218 aa  278  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  59.91 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  59.07 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  58.65 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  55.35 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  53 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  53 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  42.4 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  39.44 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  39.25 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  36.92 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  38.22 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  37.63 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  31.84 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  37.06 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  34.72 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  35.94 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  36.47 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  33.89 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.47 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  31.84 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  34.9 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  32.35 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  33.51 
 
 		 238 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  32.2 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.68 
 
 		 237 aa  98.2  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  36.31 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  36.32 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  34.22 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  33.49 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  34.88 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  43.59 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  37.2 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  34.24 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  43.4 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  30.65 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  35.98 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  34.24 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  30.14 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  33.93 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  31.31 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.14 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  34.88 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.3 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.84 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  34.25 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.84 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  43.59 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  30.57 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  33 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  32.81 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  43.59 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>