192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3963 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  95.81 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  90.23 
 
 
215 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  90.23 
 
 
215 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  89.3 
 
 
215 aa  407  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  90.23 
 
 
215 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  88.37 
 
 
215 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  81.4 
 
 
223 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  76.06 
 
 
229 aa  357  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  75.12 
 
 
230 aa  348  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  73.58 
 
 
224 aa  345  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  73.58 
 
 
224 aa  345  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  73.11 
 
 
224 aa  345  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  73.24 
 
 
219 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  72.99 
 
 
225 aa  342  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  72.51 
 
 
225 aa  342  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  73.24 
 
 
219 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  70.89 
 
 
218 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  72.99 
 
 
225 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  72.99 
 
 
225 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  71.16 
 
 
235 aa  338  4e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  70.62 
 
 
218 aa  337  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  70.14 
 
 
218 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  70.14 
 
 
218 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  71.09 
 
 
224 aa  334  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  69.34 
 
 
218 aa  324  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  66.51 
 
 
215 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  65.12 
 
 
217 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  66.51 
 
 
217 aa  307  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  64.52 
 
 
241 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  65.58 
 
 
219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  66.67 
 
 
217 aa  304  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  64.19 
 
 
219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  64.19 
 
 
219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  65.09 
 
 
220 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  66.04 
 
 
218 aa  300  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  67.92 
 
 
218 aa  297  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  61.32 
 
 
217 aa  281  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  61.14 
 
 
227 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  57.08 
 
 
221 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  56.6 
 
 
221 aa  262  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  51.64 
 
 
241 aa  239  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  51.17 
 
 
240 aa  239  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  45.75 
 
 
232 aa  218  6e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  39.91 
 
 
222 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  38.14 
 
 
246 aa  151  7e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  36.41 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  36.41 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  36.45 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  34.63 
 
 
223 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  35.47 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  31.94 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  35.19 
 
 
218 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  32.23 
 
 
215 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  32.23 
 
 
215 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  31.78 
 
 
219 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.99 
 
 
221 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 
238 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  31.43 
 
 
215 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.85 
 
 
217 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  31.79 
 
 
200 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.19 
 
 
237 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  34.65 
 
 
220 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  34.16 
 
 
220 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  33.96 
 
 
213 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  33.49 
 
 
211 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.12 
 
 
201 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  32.04 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  30.77 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  33.17 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  31.75 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.79 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  31.75 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  34.25 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  32.67 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  34.25 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  29.77 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  33.65 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  31.28 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  32.69 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  28.57 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.86 
 
 
214 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  30.14 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  32.69 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  31.69 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  33.8 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.28 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  31.69 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.15 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  31.69 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>