139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2391 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  99.09 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  88.58 
 
 		 219 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  44.6 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  43.23 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  43.92 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  43.19 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  42.44 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  43.3 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  42.13 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  42.78 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  42.64 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  41.12 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.13 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.12 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  41.03 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  40.61 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  45.83 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  40.61 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.61 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.1 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.1 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  39.23 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  41.33 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.59 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  39.59 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  39.9 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  39.9 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  39.9 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  39.9 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.09 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  41.45 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  36.62 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  39.47 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  38.95 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  36.76 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  36.62 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.51 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  37.89 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  38.79 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  37.14 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.19 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  33.49 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  37 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  32.21 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.75 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  31.73 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  36.04 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.71 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  34.69 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  34.18 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  35.86 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  31.4 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  31.58 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  31.68 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  34.88 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  34.34 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  31.12 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.35 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  28.96 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  32.81 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  32.29 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.87 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  28.17 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  29.17 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  28.44 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  39.82 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  27.86 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  26.61 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  26.61 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  26.61 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  28.11 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  28.95 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  29.47 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  29.47 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  26.39 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  27.04 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  27.55 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  27.96 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  25.69 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  28.8 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  25.69 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  25.69 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  29.31 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  28.95 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.29 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  37.38 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>