181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2097 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  96.35 
 
 
241 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  86.76 
 
 
217 aa  407  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  83.11 
 
 
219 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  82.65 
 
 
217 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  83.56 
 
 
217 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  66.36 
 
 
224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  66.36 
 
 
224 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  65.58 
 
 
225 aa  307  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  66.36 
 
 
224 aa  307  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  66.05 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  66.51 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  65.42 
 
 
224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  65.58 
 
 
218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  64.65 
 
 
225 aa  304  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  64.65 
 
 
225 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  65.75 
 
 
230 aa  304  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  64.84 
 
 
229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  64.35 
 
 
215 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  64.19 
 
 
215 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  65.58 
 
 
215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  65.58 
 
 
215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  70.83 
 
 
235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  64.95 
 
 
225 aa  301  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  64.19 
 
 
215 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  64.02 
 
 
223 aa  293  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  62.15 
 
 
218 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  62.15 
 
 
218 aa  291  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  61.68 
 
 
219 aa  290  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  61.68 
 
 
218 aa  290  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  61.68 
 
 
218 aa  290  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  61.21 
 
 
219 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  62.33 
 
 
215 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  64.1 
 
 
220 aa  275  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  60 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  57.01 
 
 
227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  59.17 
 
 
218 aa  264  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  56.48 
 
 
221 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  57.94 
 
 
217 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  55.96 
 
 
221 aa  259  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  52.53 
 
 
240 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  51.6 
 
 
241 aa  241  6e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0706  hypothetical protein  44.29 
 
 
232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0892  hypothetical protein  41.18 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  39.34 
 
 
222 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  39.34 
 
 
242 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  35.19 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  37.17 
 
 
205 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  37.17 
 
 
205 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  38 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  37.14 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  36.57 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  36.75 
 
 
220 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  39.62 
 
 
220 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  32.66 
 
 
215 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.95 
 
 
221 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  32.66 
 
 
215 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  36.59 
 
 
223 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  33.52 
 
 
201 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  36.18 
 
 
214 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  38.36 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  36.18 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  32.66 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  36.18 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  36.55 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  35.18 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  34.5 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.8 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  30.14 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  32.71 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  35.48 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  43.52 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  32.88 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  30.41 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  32.99 
 
 
214 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  35.23 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.68 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  34.59 
 
 
200 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.68 
 
 
214 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  35.23 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  35.68 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.18 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  35.68 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  35.68 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  35.68 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  35.18 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  34.8 
 
 
212 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.18 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  30.5 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.67 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  33.67 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  31.28 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.31 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.17 
 
 
214 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.17 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>