143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0278 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  46.31 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  45.41 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  44.9 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  44.39 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  45.73 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  44.9 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  41.18 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  44.93 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  46.31 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  41.63 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  43.88 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  44 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  43.69 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.23 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.23 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  43 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.75 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.23 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.75 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  43.2 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  43.22 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  44.17 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  43.72 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  43.72 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  48.85 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  45 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.2 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.2 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  48.28 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  43.94 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  42.13 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  42.44 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  45.32 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  44.17 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  38.89 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.32 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  48.82 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  40.1 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  38.61 
 
 		 220 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  41.62 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  40.61 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  40.31 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.45 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.05 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  40.93 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  39.8 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.71 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  39.9 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  41.33 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  36.59 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  37.95 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  36.71 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  37.44 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.84 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  37.95 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  34.8 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  35.03 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  36.41 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  37.95 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.44 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  34 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  34 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.63 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.33 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  33.67 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  33.5 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  32.34 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  32.12 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  38.79 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  31.25 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  31.25 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.61 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  33.16 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  34.76 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  33.84 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  31.79 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  31.79 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.38 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  31.79 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  32.47 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  34.22 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  32.82 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  31.79 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  32.31 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  32.31 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  31.96 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  34.2 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>