125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1964 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  88.19 
 
 		 237 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  57.64 
 
 		 213 aa  274  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  57.21 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  57.94 
 
 		 215 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  57.51 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  58.95 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  52.84 
 
 		 214 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  53.71 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  53.71 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  53.71 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  53.71 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  53.28 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  53.28 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  53.71 
 
 		 214 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  53.28 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  53.28 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  52.84 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.4 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.84 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  51.97 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  51.97 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  51.97 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  51.97 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  52.4 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  47.37 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  50.22 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  44.54 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  44.73 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  46.52 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  46.72 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  50.77 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  50.77 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  46.29 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  44.1 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  45.41 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  42.06 
 
 		 208 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  39.29 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  38.53 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.75 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  36.02 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  37.85 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.92 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  36.02 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  36.02 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  35.87 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  35.87 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  35.17 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  36.04 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  32.61 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  32.61 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.48 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  34.19 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.96 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  34.35 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  33.87 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  32.55 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  34.31 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  34.34 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  34.2 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.8 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.93 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  34.58 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  34.39 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  34.08 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  30.57 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.08 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  31.02 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  33.67 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  31.75 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  32.63 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  32.63 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  35.43 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  32.08 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  33.17 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  32.08 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  33.51 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  32.11 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  32.63 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  29.15 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  30.15 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  32.63 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  34.82 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  32.32 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  31.02 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  32.26 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>