154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2838 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  99.55 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  43.35 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  43.35 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  41.51 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  39.01 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  43 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  43.81 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  41.5 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  43.81 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  42.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  42.29 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  43.94 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  43.72 
 
 		 200 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  40.48 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  42.42 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  39.91 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  41.71 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  40.2 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  41.51 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  40.85 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  42.03 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  42.21 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  41.58 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  39.9 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  38.03 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  41.21 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  39.9 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  41.21 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  41.21 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  39.44 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  38.5 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  45.35 
 
 		 217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  39.23 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  38.54 
 
 		 220 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  41.75 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  42.08 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  44.44 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  42.51 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  42.51 
 
 		 209 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.15 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  41.15 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  39.71 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  39.34 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  39.34 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  40 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  36.62 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  36.15 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  44.02 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  43.52 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  37.09 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  41.9 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  41.46 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  41.46 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  41.23 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  43.68 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  40.58 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  34.74 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  36.19 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  36.92 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  38.05 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2585  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133962  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  38.65 
 
 		 211 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  36.19 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  39.7 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  35.24 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  41.45 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  36.84 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  36.02 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  41.75 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.84 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.18 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.5 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  39.9 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.02 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  37.02 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.57 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  36.36 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  35.89 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.89 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.89 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.65 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  37.62 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  36.32 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  39.58 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  40.93 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.1 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  36.84 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  34.26 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  40.41 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>