87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0639 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  59.77 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  55.98 
 
 		 265 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  57.09 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  58.5 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  59.82 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  55.15 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  55.69 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  55.45 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  48.83 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  57.44 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  55.76 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  55.3 
 
 		 647 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  52.7 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  50.79 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  52.16 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  49.06 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  48.44 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  53.57 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  50.19 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  51.01 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  49.77 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  48.18 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  49.56 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  49.78 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  45.95 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  50.22 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  45.31 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  44.49 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  43.67 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  44.08 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  43.9 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  35.65 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  36.99 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  42.34 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  40.09 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  31.35 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.62 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.62 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.58 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.08 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  26.89 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  23.35 
 
 		 397 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  37.89 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.34 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  24.3 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.61 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.99 
 
 		 415 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  39.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  26.23 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  26.83 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.75 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  27.03 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  36.79 
 
 		 214 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  28.41 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  32.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  26.37 
 
 		 410 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  34.91 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  38.68 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.94 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  43.75 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.06 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.08 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  34.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.08 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  30.36 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  36.79 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  30.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.25 
 
 		 408 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 236 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>