92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2092 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  67.63 
 
 
265 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  66.67 
 
 
257 aa  295  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  64.32 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  67.5 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  64.44 
 
 
261 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  64.32 
 
 
265 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  65.83 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  53.88 
 
 
259 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  54.85 
 
 
257 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  53.88 
 
 
263 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  53.47 
 
 
647 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  56.07 
 
 
290 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  57.68 
 
 
272 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  53.56 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  50.89 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  50.41 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  51.88 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  53.28 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  54.81 
 
 
252 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  53.28 
 
 
283 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  51.06 
 
 
256 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  46.06 
 
 
259 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  57.32 
 
 
252 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  55.32 
 
 
264 aa  228  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  52.65 
 
 
277 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  51.46 
 
 
249 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  55.65 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  50 
 
 
248 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  46.88 
 
 
254 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  48.75 
 
 
248 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  46.89 
 
 
252 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.61 
 
 
251 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  43.98 
 
 
247 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  45.19 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  36.97 
 
 
279 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  35.46 
 
 
253 aa  157  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  40.62 
 
 
248 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  42.19 
 
 
244 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 
257 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  35.55 
 
 
276 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  35.55 
 
 
276 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  29.02 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.28 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.41 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.43 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  37.08 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.87 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  27.5 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.75 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  34.65 
 
 
218 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  27.24 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.85 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  26.2 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  25 
 
 
410 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  25.1 
 
 
276 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.16 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  25.63 
 
 
423 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.01 
 
 
370 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.15 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  32.22 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.52 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  23.25 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  25.36 
 
 
356 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.93 
 
 
370 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  26.38 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.83 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.96 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
371 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  27.23 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  26.73 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  26.77 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.21 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
371 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 
371 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  27.66 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
246 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.9 
 
 
248 aa  42  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.62 
 
 
371 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
297 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
369 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
369 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
369 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>