139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1720 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  63.11 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  59.43 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  62.55 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  60 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  60 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  58.68 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  44.05 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  45.45 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  47.92 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  46.06 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  45.98 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  43.03 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  42.21 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  46.22 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  44.72 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  43.56 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  43.9 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  44.49 
 
 		 647 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  41.6 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  47.66 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  45.31 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  38.03 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  40.78 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  41.31 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  45.13 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  39.59 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  43.57 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  44.58 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  44.17 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  43.83 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  40.76 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  42.15 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  42.34 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  38.8 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  39.47 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  29.33 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  29.33 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.15 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  28.49 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  28.57 
 
 		 423 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  29.9 
 
 		 410 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.02 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  27.1 
 
 		 311 aa  52  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.67 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  23.94 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.42 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  34.31 
 
 		 405 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  29.71 
 
 		 668 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.78 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.58 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.59 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.59 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 396 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.59 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  27.72 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  28.18 
 
 		 674 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  28.86 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  32.28 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  30.25 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  30.93 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 368 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.49 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.66 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  27.72 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.16 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.83 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  37.97 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  30.66 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>