More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2537 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  32.78 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.32 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.6 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  29.29 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.59 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.48 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  26.21 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.63 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  28.68 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.37 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  30.61 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  30.86 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  24.26 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  36.43 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  28.82 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  29.27 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  39.6 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  32.8 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  25.52 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  31.95 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  25.21 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  27.35 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  29.72 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  27.41 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.19 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.51 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  31.12 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29.15 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.12 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  27.51 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.12 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  31.12 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  27.05 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  24.38 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  25.78 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.79 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  37.06 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  34.55 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  36.36 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  29.67 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  23.97 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.95 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  26.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  24.19 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  31.34 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  30.65 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  26.86 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0091  hypothetical protein  25.88 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000240765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  25.27 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  32.09 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  27.95 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  25 
 
 		 460 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  25.09 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  36 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  24.79 
 
 		 337 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  26.23 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  25.69 
 
 		 412 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  27.95 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  22.83 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.77 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  27.95 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  33.96 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.15 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  28.37 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  20.65 
 
 		 405 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>