196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  36.03 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  40 
 
 
258 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  34.34 
 
 
259 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  29.89 
 
 
255 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.21 
 
 
246 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  32.13 
 
 
274 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.8 
 
 
257 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.56 
 
 
248 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 
260 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.79 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.89 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.31 
 
 
281 aa  82  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  29.61 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  28.51 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  28.71 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  27.05 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  31.93 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  25.24 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  25.24 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  29.14 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0508  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.71 
 
 
348 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.79 
 
 
397 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  24.33 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.78 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  23.87 
 
 
405 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.46 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  28.11 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30.37 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  24.62 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  28.28 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  26.02 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  24.83 
 
 
667 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  25.76 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.01 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  27.46 
 
 
667 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  32.08 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  32.56 
 
 
580 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  25.45 
 
 
259 aa  52  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  24.6 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  35.63 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  30 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  23.95 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.69 
 
 
670 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.3 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  34.19 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  24.17 
 
 
415 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.69 
 
 
337 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  24.32 
 
 
342 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  24.32 
 
 
341 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.27 
 
 
748 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  32.39 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  23.85 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  26.13 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  31.01 
 
 
668 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  28 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  27.21 
 
 
677 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  24.47 
 
 
763 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  35.44 
 
 
680 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  26.19 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.82 
 
 
760 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  24.1 
 
 
258 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.64 
 
 
670 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  24.11 
 
 
763 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.41 
 
 
751 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  28.3 
 
 
402 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  25.64 
 
 
218 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  26.37 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  28.47 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  24.21 
 
 
338 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.79 
 
 
318 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  28.69 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  31.65 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  26.16 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  32.17 
 
 
408 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  18.95 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  24.26 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  32.63 
 
 
410 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  23.53 
 
 
320 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  34.18 
 
 
677 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  27.2 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  31.65 
 
 
674 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  23.76 
 
 
763 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>