186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0416 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0416  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  100 
 
 
500 aa  1006    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.85 
 
 
622 aa  74.3  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0507  Acylaminoacyl-peptidase  26.2 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  23.89 
 
 
618 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.66 
 
 
606 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  21.05 
 
 
609 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.88 
 
 
642 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.26 
 
 
634 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2289  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.76 
 
 
536 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.37 
 
 
673 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.39 
 
 
680 aa  57  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  22.55 
 
 
641 aa  56.6  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  24.11 
 
 
661 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  22.11 
 
 
618 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  31.4 
 
 
656 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
597 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.56 
 
 
604 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  26.54 
 
 
674 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
692 aa  55.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.4 
 
 
633 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.73 
 
 
656 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  31.4 
 
 
656 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.87 
 
 
735 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.44 
 
 
692 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0703  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.46 
 
 
621 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4095  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.41 
 
 
620 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  29.92 
 
 
722 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.29 
 
 
644 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  24.26 
 
 
720 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.83 
 
 
661 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  29.7 
 
 
608 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.77 
 
 
619 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  21.58 
 
 
664 aa  53.5  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  29.12 
 
 
596 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.44 
 
 
620 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
652 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.69 
 
 
617 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.83 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.81 
 
 
652 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 
652 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  20.54 
 
 
648 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 
652 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.21 
 
 
626 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  27.19 
 
 
729 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  21.12 
 
 
668 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.16 
 
 
623 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.69 
 
 
670 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  28.71 
 
 
608 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.03 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  21.72 
 
 
651 aa  51.2  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
735 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 
666 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.41 
 
 
596 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.98 
 
 
688 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.24 
 
 
630 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 
631 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  23.11 
 
 
702 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.71 
 
 
668 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.39 
 
 
648 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.03 
 
 
677 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  20.83 
 
 
719 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.79 
 
 
644 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  22.34 
 
 
649 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 
588 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1251  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 
638 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  22.75 
 
 
632 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.41 
 
 
602 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.8 
 
 
667 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.89 
 
 
688 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  31.3 
 
 
638 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  22.37 
 
 
695 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.21 
 
 
682 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.3 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.52 
 
 
652 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.22 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.59 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.01 
 
 
610 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 
600 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.63 
 
 
686 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.09 
 
 
698 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.95 
 
 
655 aa  48.5  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.29 
 
 
642 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0440  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.53 
 
 
536 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.37 
 
 
697 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.91 
 
 
708 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.91 
 
 
615 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.78 
 
 
645 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.47 
 
 
646 aa  47.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.77 
 
 
657 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.33 
 
 
691 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.74 
 
 
643 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 
698 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.2 
 
 
739 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.83 
 
 
677 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.92 
 
 
662 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.6 
 
 
607 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.2 
 
 
673 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.45 
 
 
607 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>