205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1622 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  97.79 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  88.21 
 
 		 265 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  60.7 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  62.18 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  62.55 
 
 		 252 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  57.61 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  53.44 
 
 		 647 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  53.82 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  56.08 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  58.33 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  53.54 
 
 		 261 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  52.63 
 
 		 259 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  57.85 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  56.79 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  58.26 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  53.16 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  50.61 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  51.2 
 
 		 277 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  53.28 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  50.2 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  46.62 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  48.31 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  51.05 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  50.21 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  49.56 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  48.33 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.93 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.58 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  49.36 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  44.17 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  45.42 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  45.61 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  34.62 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  42.08 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.1 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  34.98 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.89 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.89 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.27 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.89 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.44 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  23.83 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  28.45 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.65 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.65 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  43.42 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  42.11 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.73 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.59 
 
 		 374 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.07 
 
 		 370 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.75 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  27.67 
 
 		 410 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.51 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.15 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  26.53 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  34.56 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  43.24 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.04 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 327 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.79 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.94 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  34.41 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.41 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  23.03 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>