87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3187 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  36.59 
 
 		 893 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  42.95 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  41.33 
 
 		 634 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  42.66 
 
 		 638 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  39.63 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.87 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  36.05 
 
 		 596 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.54 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  44.83 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  38.81 
 
 		 618 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.07 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  37.41 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  29.93 
 
 		 585 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  36.7 
 
 		 605 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  36.62 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  36.62 
 
 		 618 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  36.44 
 
 		 595 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  36.44 
 
 		 595 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  37.23 
 
 		 615 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  35.77 
 
 		 1103 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  38.46 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  36.59 
 
 		 1103 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  37.96 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  41.54 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  37.96 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  37.96 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  37.96 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  38.02 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1533 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0274  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.17 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  35.38 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.06 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  33.13 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  31.75 
 
 		 608 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  31.16 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0697  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.22 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.62 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.72 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.15 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.75 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  35.29 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  32.62 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  29.46 
 
 		 597 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 374 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.01 
 
 		 442 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 473 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2278  hypothetical protein  33.6 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  38.46 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  37.5 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.36 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.99 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.09 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  31.67 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  43.04 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  31.25 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  39.44 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.78 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  35.11 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  37.61 
 
 		 580 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  38.03 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  30.53 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  34.69 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  30.71 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  30.28 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  32.5 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 462 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  30.12 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  32.26 
 
 		 259 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>