49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0651 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  98.44 
 
 
1533 aa  1206    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  98.6 
 
 
658 aa  1205    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1302    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  98.44 
 
 
658 aa  1205    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  98.39 
 
 
636 aa  1157    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  98.6 
 
 
658 aa  1205    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  83.67 
 
 
707 aa  1010    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  49.37 
 
 
618 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  49.68 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  49.13 
 
 
618 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  46.52 
 
 
595 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  46.68 
 
 
595 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  48.21 
 
 
608 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  34.98 
 
 
605 aa  290  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  34.22 
 
 
634 aa  269  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  33.33 
 
 
615 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  32.8 
 
 
614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.81 
 
 
631 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  31.21 
 
 
592 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  28.86 
 
 
636 aa  157  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
1103 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  28.45 
 
 
592 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  32.68 
 
 
1103 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  27.33 
 
 
638 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  22.18 
 
 
585 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  27.82 
 
 
638 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  30.43 
 
 
290 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  37.21 
 
 
596 aa  64.7  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  64.3  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  25.62 
 
 
334 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  37.68 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
280 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
256 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  32.98 
 
 
259 aa  51.6  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  27.78 
 
 
295 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  25.78 
 
 
261 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  31.88 
 
 
295 aa  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  34.78 
 
 
415 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.91 
 
 
304 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.24 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.08 
 
 
292 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  34.72 
 
 
255 aa  44.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
321 aa  44.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.4 
 
 
288 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  33.72 
 
 
650 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  32.97 
 
 
145 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
320 aa  44.3  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  32.28 
 
 
893 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.97 
 
 
402 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>