42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3188 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  28.29 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  33.63 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  27.47 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  35.45 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  35.45 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.15 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.06 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  39.09 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  38.1 
 
 		 658 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  38.1 
 
 		 658 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  38.1 
 
 		 636 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  38.1 
 
 		 658 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1533 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.57 
 
 		 585 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  25 
 
 		 636 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  38.61 
 
 		 618 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  45.16 
 
 		 662 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  37.89 
 
 		 595 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.26 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  46.77 
 
 		 707 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  31.03 
 
 		 597 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 631 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  39.08 
 
 		 595 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 634 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  37.86 
 
 		 618 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.27 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  35.58 
 
 		 467 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  28.12 
 
 		 618 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  32.22 
 
 		 451 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  32.41 
 
 		 1103 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.63 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 1103 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  28.8 
 
 		 615 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  25 
 
 		 605 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  30.36 
 
 		 592 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  31.31 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.83 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.48 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>