48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4094 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  81.13 
 
 		 618 aa  980    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  95.63 
 
 		 618 aa  1176    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1231    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  52.61 
 
 		 707 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  49.68 
 
 		 658 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  49.68 
 
 		 658 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  49.68 
 
 		 658 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  49.52 
 
 		 1533 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  49.37 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  49.5 
 
 		 636 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  44.12 
 
 		 595 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  44.12 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  46.59 
 
 		 608 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  36.07 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  36.1 
 
 		 634 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  33.73 
 
 		 615 aa  267  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  34 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.55 
 
 		 631 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  33.55 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  29.78 
 
 		 636 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  27.99 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 1103 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 1103 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.75 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  28 
 
 		 596 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  21.99 
 
 		 597 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  28.25 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  36.62 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.12 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  26.25 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  28.15 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  25.69 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  26.37 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  31.68 
 
 		 893 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  34.72 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.43 
 
 		 292 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 280 aa  51.6  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.03 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 315 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.76 
 
 		 246 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.88 
 
 		 288 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.15 
 
 		 215 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 319 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  34.65 
 
 		 295 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.59 
 
 		 304 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.33 
 
 		 276 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  31.69 
 
 		 218 aa  43.9  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>