45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2430 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  51.46 
 
 
288 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.86 
 
 
318 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  45.17 
 
 
295 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.57 
 
 
304 aa  244  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.81 
 
 
292 aa  236  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.55 
 
 
304 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
280 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.22 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  34.87 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  51.09 
 
 
131 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  26.8 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  32.02 
 
 
638 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  31.53 
 
 
638 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.37 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  30.15 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  31.58 
 
 
592 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.85 
 
 
631 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.15 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
374 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  37.35 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0307  hypothetical protein  34.34 
 
 
111 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  25.7 
 
 
597 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  26.57 
 
 
636 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  36.64 
 
 
615 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  30.08 
 
 
261 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  29.14 
 
 
1103 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  29.12 
 
 
585 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  37.96 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  24.91 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  23.88 
 
 
614 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  31.96 
 
 
474 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  29.37 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.53 
 
 
580 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
1103 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  34.07 
 
 
592 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  35.8 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  22.92 
 
 
605 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  27.35 
 
 
595 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  39.39 
 
 
465 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  35.96 
 
 
201 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>