33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0170 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1239    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  24.79 
 
 		 585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  24.13 
 
 		 634 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  22.71 
 
 		 615 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  26.55 
 
 		 614 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  21.92 
 
 		 618 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  21.99 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  20.26 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  24.39 
 
 		 592 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  22.54 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  21.31 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 1103 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.03 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 1103 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.4 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  26.57 
 
 		 295 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  23.26 
 
 		 707 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  26.43 
 
 		 592 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.7 
 
 		 285 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  21.27 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  21.27 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.94 
 
 		 288 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  29.46 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  20.42 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  29.52 
 
 		 295 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.73 
 
 		 304 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.06 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 287 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.23 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  22.31 
 
 		 608 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.54 
 
 		 304 aa  44.3  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>