48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6018 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1293    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  43.53 
 
 		 1103 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  43.65 
 
 		 1103 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  41.26 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  29.52 
 
 		 592 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  28.86 
 
 		 634 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  29.78 
 
 		 618 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  28.95 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  29.54 
 
 		 618 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  29.97 
 
 		 618 aa  171  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  28.79 
 
 		 614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  29.27 
 
 		 595 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  29.27 
 
 		 595 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  29.34 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  29.15 
 
 		 707 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  28.37 
 
 		 658 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  28.37 
 
 		 658 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  28.37 
 
 		 658 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.62 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  28.36 
 
 		 636 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1533 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  29.04 
 
 		 608 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  28.82 
 
 		 662 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  24.4 
 
 		 585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  28.25 
 
 		 588 aa  87.4  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  20.26 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  28.38 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  37.41 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  25.16 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.93 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  25.31 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  38.66 
 
 		 893 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  25.49 
 
 		 638 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  27.84 
 
 		 290 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.11 
 
 		 292 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 		 256 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.57 
 
 		 285 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.69 
 
 		 318 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.23 
 
 		 304 aa  52  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.66 
 
 		 276 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  26.39 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.67 
 
 		 258 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  31.3 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  34.65 
 
 		 330 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 341 aa  43.9  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>