34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1079 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1201    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 588 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  29.56 
 
 		 634 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  28 
 
 		 618 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  26.94 
 
 		 614 aa  97.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  28.13 
 
 		 618 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  28.45 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  27.56 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 1103 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  26.7 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  26 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  36.05 
 
 		 272 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  39.72 
 
 		 893 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  25.25 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  25.09 
 
 		 592 aa  72  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  32.61 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  33.78 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  25.16 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  37.21 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  37.21 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  37.21 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  36.43 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1533 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  37.21 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  37.4 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.78 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 1103 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  26.08 
 
 		 615 aa  53.9  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  33.81 
 
 		 638 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  26.02 
 
 		 608 aa  51.6  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  32.81 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  33.81 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>