27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1571 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  55.64 
 
 
597 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  54.65 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.5 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.78 
 
 
276 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0697  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.03 
 
 
290 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0274  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.22 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.47 
 
 
256 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  32.24 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
588 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  35.91 
 
 
638 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  36.07 
 
 
638 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1933  hypothetical protein  29.94 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  24.7 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  28.96 
 
 
596 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0304  hypothetical protein  25.35 
 
 
161 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  33.61 
 
 
634 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2341  hypothetical protein  27.33 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  30.5 
 
 
893 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  30.53 
 
 
402 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.12 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  28.42 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  29.66 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  28.89 
 
 
618 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43352  predicted protein  26.81 
 
 
347 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0470294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>