74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2516 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  100 
 
 
634 aa  1272    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  46.7 
 
 
614 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  36.26 
 
 
618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  36.62 
 
 
618 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.54 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  35.42 
 
 
605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  35.38 
 
 
618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  36.58 
 
 
615 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  34.8 
 
 
595 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  34.82 
 
 
658 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  34.82 
 
 
658 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  34.97 
 
 
595 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  34.82 
 
 
658 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  35.25 
 
 
707 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  34.66 
 
 
1533 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  34.76 
 
 
662 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  34.1 
 
 
636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  33.56 
 
 
608 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  34.27 
 
 
592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  28.41 
 
 
636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  29.27 
 
 
592 aa  187  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
1103 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
1103 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.47 
 
 
585 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  29.2 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  24.02 
 
 
597 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  37.68 
 
 
290 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  29.28 
 
 
588 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  41.33 
 
 
272 aa  87  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  45.52 
 
 
893 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  28.04 
 
 
638 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  28.63 
 
 
638 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  33.88 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.29 
 
 
276 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.7 
 
 
281 aa  57.4  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  36.04 
 
 
261 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
597 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.38 
 
 
292 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
282 aa  51.2  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  35.71 
 
 
295 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  38.14 
 
 
246 aa  50.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.41 
 
 
248 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  32.14 
 
 
258 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  27.84 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.8 
 
 
256 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
273 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  29.31 
 
 
295 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41254  predicted protein  29.69 
 
 
284 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.401564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
374 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  38.71 
 
 
473 aa  47.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.5 
 
 
318 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.57 
 
 
311 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  30.77 
 
 
306 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
313 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 
259 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.23 
 
 
261 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.97 
 
 
255 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.58 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
341 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  23.74 
 
 
405 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 
274 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
257 aa  45.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  27.32 
 
 
257 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.81 
 
 
313 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  31.36 
 
 
690 aa  45.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  33.58 
 
 
275 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 
280 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
315 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  37.65 
 
 
677 aa  43.9  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  28.43 
 
 
402 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  26.14 
 
 
259 aa  43.9  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>