129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1948 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  100 
 
 		 473 aa  978    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  37.75 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  37 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  36.34 
 
 		 580 aa  230  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  26.71 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  29.31 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  25.58 
 
 		 319 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  33.77 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  31.48 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  30.86 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  26.65 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  26.65 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  32.73 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  25.9 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  36.67 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  30.86 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  30.27 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  30.68 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  29.89 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  29.89 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  29.23 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  26.87 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.75 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  27.45 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  28.57 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  34.65 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  26 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  32.08 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  31.75 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  32.47 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.59 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.59 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  31.54 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  24.44 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  28.77 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  34.21 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.99 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  31.65 
 
 		 323 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  30.25 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  25.49 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  31.67 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  32.59 
 
 		 315 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  35.85 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.1 
 
 		 251 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.48 
 
 		 246 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  31.65 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  29.86 
 
 		 269 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  34.12 
 
 		 257 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  25.12 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  25.13 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  25.13 
 
 		 362 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  25.13 
 
 		 460 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  25.13 
 
 		 362 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  25.13 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  28.78 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  28.36 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.94 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  40.22 
 
 		 256 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  25.61 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  36.17 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  27.81 
 
 		 290 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  24.2 
 
 		 333 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.33 
 
 		 274 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  29.63 
 
 		 343 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  26.47 
 
 		 333 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  27.03 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  30.81 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  30.81 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  38.71 
 
 		 634 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  25.62 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 319 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  29.32 
 
 		 402 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.93 
 
 		 279 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 		 270 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  28.07 
 
 		 263 aa  47  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  41.18 
 
 		 259 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  33.33 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.4 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  31.76 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  31.91 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>