43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4119 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 1103 aa  2206    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  92.57 
 
 		 1103 aa  2026    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  43.62 
 
 		 636 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  43.28 
 
 		 592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  48.04 
 
 		 506 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  32.03 
 
 		 592 aa  227  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  30.8 
 
 		 614 aa  198  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  28.64 
 
 		 605 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  27.66 
 
 		 634 aa  172  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  26.76 
 
 		 595 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 509 aa  167  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  28.24 
 
 		 618 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  28.14 
 
 		 618 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  26.51 
 
 		 595 aa  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  27.68 
 
 		 615 aa  154  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  28.79 
 
 		 618 aa  152  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.62 
 
 		 631 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1078  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 511 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0468263  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  28.3 
 
 		 658 aa  144  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  28.3 
 
 		 658 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  28.3 
 
 		 658 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  27.62 
 
 		 608 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  28.43 
 
 		 636 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  28.12 
 
 		 662 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  27.98 
 
 		 707 aa  126  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.72 
 
 		 585 aa  116  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  28.16 
 
 		 588 aa  102  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  25.2 
 
 		 638 aa  81.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  24.2 
 
 		 596 aa  72  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  24.4 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  26.35 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  35.77 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  20.77 
 
 		 597 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  30.56 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.45 
 
 		 476 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  35.29 
 
 		 893 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.09 
 
 		 304 aa  48.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 487 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 256 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 440 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 424 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>