26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4269 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 440 aa  850    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  59.62 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  27.57 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  20.29 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 1103 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  26.79 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 		 1103 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.56 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  35.38 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4438  polysaccharide biosynthesis protein  28.66 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 511 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.89 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>