104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1211 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 489 aa  960    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 495 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 529 aa  176  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 539 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  25.88 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.95 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.98 
 
 		 496 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 495 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  20.44 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  24.32 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  43.02 
 
 		 135 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  25.89 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  23.56 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.73 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  23.76 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  23.36 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 490 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  20.69 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.36 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.14 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.5 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 489 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 526 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 547 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  26.26 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 583 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 477 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.19 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  18.77 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  20.41 
 
 		 487 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 502 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2480  stage V sporulation protein B  24.66 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>