74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0483 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  926    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  48.51 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  47.23 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  43.47 
 
 		 583 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  49.58 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  31.46 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  35.08 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  28.65 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.52 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  32 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 489 aa  57  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  32.41 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.46 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 435 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  26.96 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  30.93 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 539 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0838  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  26.17 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0861  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.371179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 519 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.55 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  38.67 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  25.68 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.51 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>