22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2768 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  100 
 
 		 508 aa  1000    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  28.69 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  29.8 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  27.83 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  31.09 
 
 		 489 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 498 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  28.12 
 
 		 484 aa  181  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  32.19 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.11 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.44 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.94 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  18.56 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>