37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1920 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 484 aa  967    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  42.36 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  42.2 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  28.29 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  24.26 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  25.39 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  24.3 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.05 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.84 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  21.27 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 475 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 		 499 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  19.7 
 
 		 490 aa  50.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  22.01 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  20.26 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  20.81 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>