13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0133 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  999    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  32.97 
 
 		 472 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  27.83 
 
 		 508 aa  236  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  28.15 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.75 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 484 aa  134  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.65 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.33 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>