12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4704 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 498 aa  979    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 472 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  25.93 
 
 		 508 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  27.55 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  24.3 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  27.38 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 484 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.65 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>