51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08851 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  961    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  43.39 
 
 
489 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  42.36 
 
 
484 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  28.12 
 
 
508 aa  190  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  25.35 
 
 
499 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4704  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318996  normal  0.409753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  25.42 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  25.95 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  19.41 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
423 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
489 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  19.41 
 
 
539 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
496 aa  54.7  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  20.92 
 
 
495 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.61 
 
 
506 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
444 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.61 
 
 
506 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
475 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  22.61 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 
494 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.35 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  19.32 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  22.61 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  20.87 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.39 
 
 
506 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 
495 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
441 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 
482 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  23.32 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.99 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
504 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
507 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  23.91 
 
 
495 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 
407 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
444 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.68 
 
 
490 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>