121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0528 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  100 
 
 
464 aa  907    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
483 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
483 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  27.03 
 
 
430 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
478 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
467 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
472 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
482 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 
477 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.67 
 
 
488 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
493 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.41 
 
 
461 aa  90.1  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.51 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  26.27 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.3 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  23.95 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  21.83 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
471 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 
475 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
500 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 
480 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  19.23 
 
 
538 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
497 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 
478 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 
449 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
435 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
482 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.7 
 
 
517 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
461 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  27.06 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  41.25 
 
 
583 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
440 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
500 aa  53.9  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.57 
 
 
490 aa  53.9  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.61 
 
 
511 aa  53.5  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
499 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 
426 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  20.85 
 
 
508 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  30.53 
 
 
493 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
480 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
463 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
451 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
433 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  19.38 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
506 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>