47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2124 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  917    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  43.91 
 
 		 471 aa  319  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  38.66 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  39.76 
 
 		 468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  36.43 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 483 aa  133  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 483 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.41 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  22.89 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  30.34 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 493 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.05 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  23.35 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.88 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.65 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  22.28 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 583 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>