122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2971 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 475 aa  929    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  47.87 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  32.89 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 492 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  31.07 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 494 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1817  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.62 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.24 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30.36 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.56 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 529 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 433 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.18 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.22 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 		 539 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  19.84 
 
 		 553 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 499 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.7 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  22.85 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  23.08 
 
 		 525 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.34 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>