147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2504 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
486 aa  954    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  35.16 
 
 
490 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  33.4 
 
 
483 aa  261  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 
489 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.3 
 
 
517 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
514 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  24.03 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.23 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
506 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.22 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
486 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
433 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  22.96 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
495 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.96 
 
 
506 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.96 
 
 
506 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  27.06 
 
 
495 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
506 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
494 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
440 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.36 
 
 
506 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 
539 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 
519 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
583 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
506 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 
418 aa  58.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
480 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.87 
 
 
506 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.64 
 
 
488 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 
529 aa  57  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 
546 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.48 
 
 
453 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  23.63 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  24.22 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
539 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
505 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
500 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  24.88 
 
 
448 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
507 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 
461 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 
434 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  18.92 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  23.4 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  19.01 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  23.22 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
423 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 
471 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
506 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
504 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
490 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  21.98 
 
 
544 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
441 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 
477 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
449 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 
474 aa  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  20.59 
 
 
510 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  24.42 
 
 
496 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.05 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  20.26 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  24.58 
 
 
522 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4270  hypothetical protein  22.18 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.796058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 
520 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
475 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
504 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0175  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
449 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>