99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6018 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  81.52 
 
 		 444 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 433 aa  859    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  54.63 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  33.5 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  29.57 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  29.57 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  29.57 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  27.96 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  29.32 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  29.32 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  29.32 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  29.32 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  32.49 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.99 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  24.02 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  19.33 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 429 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  25.13 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 426 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  21.02 
 
 		 484 aa  93.6  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.53 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  20.61 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.18 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  21.58 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  17.48 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  22.17 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 484 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.79 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  19.95 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  19.78 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  19.78 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  19.78 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  19.78 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  19.72 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 483 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  25.19 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  18.68 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 500 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  25.32 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.26 
 
 		 483 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>