89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2041 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 415 aa  816    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  33.17 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  33.17 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  33.17 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  33.17 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  33.17 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  33.17 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  33.17 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  32.68 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  34.49 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  34.22 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  32.68 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  33.7 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 429 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  30.02 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  31.06 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 433 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 443 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  27.23 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  28.75 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  27.53 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 421 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 477 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.94 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 478 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.13 
 
 		 475 aa  97.1  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 486 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.41 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.03 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.69 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.58 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.72 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  27.63 
 
 		 472 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.66 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.43 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  21.43 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.1 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  18.45 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.56 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  20.06 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 506 aa  43.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>