153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3930 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 480 aa  955    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.18 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.53 
 
 		 493 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.84 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 498 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  26.57 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  26.57 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  26.57 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  26.57 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 503 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  26.29 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 499 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.15 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  26.29 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  26.29 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 514 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 503 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  26.07 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.69 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.64 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  24.53 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  26.93 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.31 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.14 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.14 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 502 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.32 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.07 
 
 		 510 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 497 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.38 
 
 		 508 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  24.22 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 493 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.04 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 575 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.05 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.24 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  27.65 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>