149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01400 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  100 
 
 
497 aa  981    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  65.13 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  65.13 
 
 
510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  46.69 
 
 
575 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  48.07 
 
 
514 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  44.64 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 
508 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  33.7 
 
 
500 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  35.32 
 
 
507 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  36.95 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  32.45 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  36.12 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 
503 aa  213  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  32.94 
 
 
501 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  34.5 
 
 
501 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  32.84 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  32.92 
 
 
504 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 
501 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  31.71 
 
 
504 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
490 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 
476 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  30.06 
 
 
483 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.39 
 
 
493 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
486 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  25.95 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.77 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.77 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.5 
 
 
492 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.04 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.5 
 
 
492 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.5 
 
 
492 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.69 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.69 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.55 
 
 
503 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.15 
 
 
510 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.69 
 
 
510 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.04 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.32 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
487 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
489 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 
484 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
497 aa  124  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
502 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
483 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
520 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 
503 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  24.42 
 
 
479 aa  114  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
502 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 
484 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
502 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
477 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.33 
 
 
488 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 
530 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
423 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
499 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
471 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 
498 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
503 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.99 
 
 
475 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.99 
 
 
474 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 
493 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 
500 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 
494 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
479 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
488 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
483 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.75 
 
 
512 aa  97.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
507 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
509 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 
467 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 
490 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
488 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
492 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
500 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
508 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
504 aa  91.3  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
510 aa  91.3  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.19 
 
 
505 aa  91.3  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
504 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
494 aa  90.1  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
500 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 
502 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
424 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  23.44 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>