108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3544 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
530 aa  1016    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
476 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.44 
 
 
483 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
507 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 
575 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  28.29 
 
 
497 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.22 
 
 
493 aa  87  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  27.15 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 
486 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.98 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.42 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.42 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.42 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.42 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.42 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
494 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.49 
 
 
492 aa  72  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  20.84 
 
 
487 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
498 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.6 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.57 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.6 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.5 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.5 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.24 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.5 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.5 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.57 
 
 
488 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.24 
 
 
492 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
484 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
497 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 
479 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.24 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 
483 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.8 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
500 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.98 
 
 
508 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 
491 aa  61.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.13 
 
 
505 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
492 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.14 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 
500 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
421 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
498 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
520 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
502 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
500 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
487 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
493 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
499 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  26.8 
 
 
437 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
502 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  21.79 
 
 
512 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
504 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1380  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
471 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0611611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
507 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
483 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  23.29 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  21.85 
 
 
504 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
490 aa  47.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>