162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2335 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 490 aa  974    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 		 487 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  34.51 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  29.98 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  29.98 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  30.7 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 489 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  29.3 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 499 aa  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 503 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.84 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 503 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  28.33 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  24.78 
 
 		 452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.03 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.95 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.56 
 
 		 501 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  23.2 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.36 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.36 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  21.56 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.15 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.15 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.94 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.94 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.15 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.57 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  22.61 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  20.82 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.08 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.08 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.08 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.38 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.38 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.5 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 424 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 477 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 499 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.84 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 575 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  24.63 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  25.24 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.05 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  23.9 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 504 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0143  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 514 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1380  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0611611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>